Katedra systémového inženýrství pokračuje v tradici dřívějších kateder, tj. Katedry systémového inženýrství a Katedry automatizovaných systémů řízení v ekonomice, jenž patřily k nejstarším katedrám na Ekonomické fakultě, a rozšiřuje ji o nová, moderní, odborná témata. Navazuje na dlouholetou zkušenost s výchovou specialistů - systémových inženýrů v nejrůznějších oblastech pro podporu managementu.
Odborné zaměření členů katedry pokrývá problematiku kvantitativní a informatické podpory různých oblastí systému řízení v organizacích a institucích.